Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YARSP54577 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YARSP54577 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YARSP54577 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YARSP54577 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YARSP54577 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YARSP54577 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YARSP54577 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YARSP54577 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YARSP54577 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YARSP54577 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YARSP54577 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YARSP54577 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
YARSP54577 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YARSP54577 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
YARSP54577 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
YARSP54577 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YARSP54577 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YARSP54577 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YARSP54577 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YARSP54577 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YARSP54577 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YARSP54577 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YARSP54577 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YARSP54577 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YARSP54577 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YARSP54577 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YARSP54577 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YARSP54577 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YARSP54577 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YARSP54577 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YARSP54577 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YARSP54577 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YARSP54577 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YARSP54577 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YARSP54577 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YARSP54577 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YARSP54577 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YARSP54577 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YARSP54577 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
YARSP54577 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YARSP54577 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YARSP54577 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YARSP54577 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YARSP54577 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YARSP54577 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YARSP54577 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
YARSP54577 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
YARSP54577 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YARSP54577 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YARSP54577 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YARSP54577 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YARSP54577 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YARSP54577 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YARSP54577 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YARSP54577 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YARSP54577 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YARSP54577 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YARSP54577 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
YARSP54577 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YARSP54577 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YARSP54577 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YARSP54577 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YARSP54577 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YARSP54577 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YARSP54577 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YARSP54577 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YARSP54577 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YARSP54577 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YARSP54577 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YARSP54577 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YARSP54577 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YARSP54577 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YARSP54577 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YARSP54577 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YARSP54577 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YARSP54577 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
YARSP54577 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YARSP54577 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YARSP54577 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YARSP54577 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YARSP54577 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YARSP54577 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
YARSP54577 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YARSP54577 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YARSP54577 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
YARSP54577 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YARSP54577 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YARSP54577 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YARSP54577 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YARSP54577 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YARSP54577 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YARSP54577 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YARSP54577 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YARSP54577 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YARSP54577 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YARSP54577 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YARSP54577 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YARSP54577 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YARSP54577 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms