Protein–RNA interactions for Protein: P53965

SIW14, Tyrosine-protein phosphatase SIW14, yeastyeast

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIW14P53965 PPM1YDR435C 987 nt5.87□□□□□ -1.47
SIW14P53965 RSM27YGR215W 333 nt5.87□□□□□ -1.47
SIW14P53965 SPO7YAL009W 780 nt5.87□□□□□ -1.47
SIW14P53965 YLR339CYLR339C 552 nt5.87□□□□□ -1.47
SIW14P53965 YML6YML025C 861 nt5.87□□□□□ -1.47
SIW14P53965 MGE1YOR232W 687 nt5.87□□□□□ -1.47
SIW14P53965 NOB1YOR056C 1380 nt5.87□□□□□ -1.47
SIW14P53965 MET3YJR010W 1536 nt5.87□□□□□ -1.47
SIW14P53965 HXT4YHR092C 1731 nt5.87□□□□□ -1.47
SIW14P53965 PUT1YLR142W 1431 nt5.86□□□□□ -1.47
SIW14P53965 FBP26YJL155C 1359 nt5.86□□□□□ -1.47
SIW14P53965 TYR1YBR166C 1359 nt5.86□□□□□ -1.47
SIW14P53965 KIN28YDL108W 921 nt5.86□□□□□ -1.47
SIW14P53965 snR83snR83 306 nt5.86□□□□□ -1.47
SIW14P53965 RAV2YDR202C 1056 nt5.86□□□□□ -1.47
SIW14P53965 COX17YLL009C 210 nt5.86□□□□□ -1.47
SIW14P53965 SEN34YAR008W 828 nt5.86□□□□□ -1.47
SIW14P53965 IRC13YOR235W 315 nt5.86□□□□□ -1.47
SIW14P53965 DIM1YPL266W 957 nt5.86□□□□□ -1.47
SIW14P53965 SPP381YBR152W 876 nt5.86□□□□□ -1.47
SIW14P53965 NGR1YBR212W 2019 nt5.86□□□□□ -1.47
SIW14P53965 YJR061WYJR061W 2808 nt5.85□□□□□ -1.47
SIW14P53965 SET5YHR207C 1581 nt5.85□□□□□ -1.47
SIW14P53965 MRK1YDL079C 1506 nt5.85□□□□□ -1.47
SIW14P53965 VPS4YPR173C 1314 nt5.85□□□□□ -1.47
SIW14P53965 SCM3YDL139C 672 nt5.85□□□□□ -1.47
SIW14P53965 CTH1YDR151C 978 nt5.85□□□□□ -1.47
SIW14P53965 YER010CYER010C 705 nt5.85□□□□□ -1.47
SIW14P53965 CWC23YGL128C 852 nt5.85□□□□□ -1.47
SIW14P53965 RPL24BYGR148C 468 nt5.85□□□□□ -1.47
SIW14P53965 ASK1YKL052C 879 nt5.85□□□□□ -1.47
SIW14P53965 YKR051WYKR051W 1257 nt5.85□□□□□ -1.47
SIW14P53965 GAT3YLR013W 426 nt5.85□□□□□ -1.47
SIW14P53965 YNG1YOR064C 660 nt5.85□□□□□ -1.47
SIW14P53965 VMA4YOR332W 702 nt5.85□□□□□ -1.47
SIW14P53965 ARA1YBR149W 1035 nt5.85□□□□□ -1.47
SIW14P53965 FLC3YGL139W 2409 nt5.85□□□□□ -1.47
SIW14P53965 SPS2YDR522C 1509 nt5.84□□□□□ -1.47
SIW14P53965 DIA3YDL024C 1407 nt5.84□□□□□ -1.47
SIW14P53965 TRM13YOL125W 1431 nt5.84□□□□□ -1.47
SIW14P53965 HOS1YPR068C 1413 nt5.84□□□□□ -1.47
SIW14P53965 COM2YER130C 1332 nt5.84□□□□□ -1.47
SIW14P53965 ASA1YPR085C 1332 nt5.84□□□□□ -1.47
SIW14P53965 YER186CYER186C 921 nt5.84□□□□□ -1.47
SIW14P53965 YFL019CYFL019C 354 nt5.84□□□□□ -1.47
SIW14P53965 RTA1YGR213C 954 nt5.84□□□□□ -1.47
SIW14P53965 YML119WYML119W 1074 nt5.84□□□□□ -1.47
SIW14P53965 SHE1YBL031W 1017 nt5.84□□□□□ -1.47
SIW14P53965 SHP1YBL058W 1272 nt5.84□□□□□ -1.47
SIW14P53965 YNL050CYNL050C 813 nt5.84□□□□□ -1.47
SIW14P53965 YNL108CYNL108C 813 nt5.84□□□□□ -1.47
SIW14P53965 SPS18YNL204C 903 nt5.84□□□□□ -1.47
SIW14P53965 PDR16YNL231C 1056 nt5.84□□□□□ -1.47
SIW14P53965 RPS9AYPL081W 594 nt5.84□□□□□ -1.47
SIW14P53965 RPS9BYBR189W 588 nt5.84□□□□□ -1.47
SIW14P53965 SCT1YBL011W 2280 nt5.84□□□□□ -1.47
SIW14P53965 TOS4YLR183C 1470 nt5.83□□□□□ -1.48
SIW14P53965 PKC1YBL105C 3456 nt5.83□□□□□ -1.48
SIW14P53965 RNR3YIL066C 2610 nt5.83□□□□□ -1.48
SIW14P53965 SPC97YHR172W 2472 nt5.83□□□□□ -1.48
SIW14P53965 TMN2YDR107C 2019 nt5.83□□□□□ -1.48
SIW14P53965 YDR056CYDR056C 618 nt5.83□□□□□ -1.48
SIW14P53965 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.83□□□□□ -1.48
SIW14P53965 RPS2YGL123W 765 nt5.83□□□□□ -1.48
SIW14P53965 RHO4YKR055W 876 nt5.83□□□□□ -1.48
SIW14P53965 YAL069WYAL069W 315 nt5.83□□□□□ -1.48
SIW14P53965 TMA16YOR252W 537 nt5.83□□□□□ -1.48
SIW14P53965 NAT3YPR131C 588 nt5.83□□□□□ -1.48
SIW14P53965 HSP78YDR258C 2436 nt5.83□□□□□ -1.48
SIW14P53965 MET7YOR241W 1647 nt5.82□□□□□ -1.48
SIW14P53965 PEX21YGR239C 867 nt5.82□□□□□ -1.48
SIW14P53965 YJL218WYJL218W 591 nt5.82□□□□□ -1.48
SIW14P53965 FIP1YJR093C 984 nt5.82□□□□□ -1.48
SIW14P53965 RPL10YLR075W 666 nt5.82□□□□□ -1.48
SIW14P53965 YLR462WYLR462W 609 nt5.82□□□□□ -1.48
SIW14P53965 YBL096CYBL096C 309 nt5.82□□□□□ -1.48
SIW14P53965 ATG34YOL083W 1239 nt5.82□□□□□ -1.48
SIW14P53965 JID1YPR061C 906 nt5.82□□□□□ -1.48
SIW14P53965 YPR202WYPR202W 717 nt5.82□□□□□ -1.48
SIW14P53965 CNS1YBR155W 1158 nt5.82□□□□□ -1.48
SIW14P53965 PCL8YPL219W 1479 nt5.82□□□□□ -1.48
SIW14P53965 YDL109CYDL109C 1944 nt5.82□□□□□ -1.48
SIW14P53965 ERG7YHR072W 2196 nt5.82□□□□□ -1.48
SIW14P53965 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt5.81□□□□□ -1.48
SIW14P53965 EIS1YMR031C 2532 nt5.81□□□□□ -1.48
SIW14P53965 NBP2YDR162C 711 nt5.81□□□□□ -1.48
SIW14P53965 BTT1YDR252W 450 nt5.81□□□□□ -1.48
SIW14P53965 IRC22YEL001C 678 nt5.81□□□□□ -1.48
SIW14P53965 IST3YIR005W 447 nt5.81□□□□□ -1.48
SIW14P53965 STM1YLR150W 822 nt5.81□□□□□ -1.48
SIW14P53965 YBR063CYBR063C 1215 nt5.81□□□□□ -1.48
SIW14P53965 ICS2YBR157C 768 nt5.81□□□□□ -1.48
SIW14P53965 snR44snR44 211 nt5.81□□□□□ -1.48
SIW14P53965 SRB6YBR253W 366 nt5.81□□□□□ -1.48
SIW14P53965 AMD1YML035C 2433 nt5.81□□□□□ -1.48
SIW14P53965 PUF3YLL013C 2640 nt5.81□□□□□ -1.48
SIW14P53965 GIP1YBR045C 1920 nt5.81□□□□□ -1.48
SIW14P53965 VNX1YNL321W 2727 nt5.8□□□□□ -1.48
SIW14P53965 RDI1YDL135C 609 nt5.8□□□□□ -1.48
SIW14P53965 RPL12AYEL054C 498 nt5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms