Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	YOL153C	YOL153C	1746 nt		4.66	□□□□□ -1.66
DSL1	P53847	GIP4	YAL031C	2283 nt		4.65	□□□□□ -1.66
DSL1	P53847	IBA57	YJR122W	1494 nt		4.65	□□□□□ -1.66
DSL1	P53847	CAB1	YDR531W	1104 nt		4.65	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	YGR153W	YGR153W	654 nt		4.65	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	YLR194C	YLR194C	765 nt		4.65	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	ORM2	YLR350W	651 nt		4.65	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	TDA5	YLR426W	981 nt		4.65	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	YML057C-A	YML057C-A	390 nt		4.65	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	GPI12	YMR281W	915 nt		4.65	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	MCM2	YBL023C	2607 nt		4.65	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	PAF1	YBR279W	1338 nt		4.65	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	FRS1	YLR060W	1788 nt		4.65	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	EUG1	YDR518W	1554 nt		4.65	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	ULS1	YOR191W	4860 nt		4.64	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	HXT4	YHR092C	1731 nt		4.64	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	GSP2	YOR185C	663 nt		4.64	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	SAM4	YPL273W	978 nt		4.64	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	FES1	YBR101C	873 nt		4.64	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	NUG1	YER006W	1563 nt		4.64	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	JEM1	YJL073W	1938 nt		4.64	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	CBP1	YJL209W	1965 nt		4.64	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	SWC3	YAL011W	1878 nt		4.63	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	YDR445C	YDR445C	408 nt		4.63	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	PFA5	YDR459C	1125 nt		4.63	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	RIP1	YEL024W	648 nt		4.63	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	RPL8A	YHL033C	771 nt		4.63	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	MTC2	YKL098W	1074 nt		4.63	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	YMR114C	YMR114C	1107 nt		4.63	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	TRS85	YDR108W	2097 nt		4.63	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	OLE1	YGL055W	1533 nt		4.62	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	YML020W	YML020W	1995 nt		4.62	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	AIR2	YDL175C	1035 nt		4.62	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	YHP1	YDR451C	1062 nt		4.62	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	YGR182C	YGR182C	354 nt		4.62	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	WSS1	YHR134W	810 nt		4.62	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	MAP1	YLR244C	1164 nt		4.62	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	ROT1	YMR200W	771 nt		4.62	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	YMR315W	YMR315W	1050 nt		4.62	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	KEX1	YGL203C	2190 nt		4.62	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	NUP2	YLR335W	2163 nt		4.62	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	IKS1	YJL057C	2004 nt		4.62	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	PEP5	YMR231W	3090 nt		4.61	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	MED2	YDL005C	1296 nt		4.61	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	UBC1	YDR177W	648 nt		4.61	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	MF(ALPHA)2	YGL089C	363 nt		4.61	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	SYF2	YGR129W	648 nt		4.61	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	NTR2	YKR022C	969 nt		4.61	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	RFU1	YLR073C	603 nt		4.61	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	MDG1	YNL173C	1101 nt		4.61	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	YNL174W	YNL174W	573 nt		4.61	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	IFM1	YOL023W	2031 nt		4.61	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	MCP2	YLR253W	1710 nt		4.6	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	HOS3	YPL116W	2094 nt		4.6	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	RAD1	YPL022W	3303 nt		4.6	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	LAS21	YJL062W	2493 nt		4.6	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	ARP2	YDL029W	1176 nt		4.6	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	YDR274C	YDR274C	372 nt		4.6	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	MOB2	YFL034C-B	864 nt		4.6	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	UBI4	YLL039C	1146 nt		4.6	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	YMR082C	YMR082C	357 nt		4.6	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	TAF12	YDR145W	1620 nt		4.6	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	MEF2	YJL102W	2460 nt		4.6	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	HMG1	YML075C	3165 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	RHB1	YCR027C	630 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	RVB1	YDR190C	1392 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	MHR1	YDR296W	681 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	MCM21	YDR318W	1107 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	DEG1	YFL001W	1329 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	DSD1	YGL196W	1287 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	PUS6	YGR169C	1215 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	YIR018C-A	YIR018C-A	138 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	RPL43B	YJR094W-A	279 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	RMI1	YPL024W	726 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	RDH54	YBR073W	2877 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DSL1	P53847	IMA3	YIL172C	1770 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	IMA4	YJL221C	1770 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	HCM1	YCR065W	1695 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	RSC30	YHR056C	2652 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	YDR134C	YDR134C	411 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	FAU1	YER183C	636 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	ERG26	YGL001C	1050 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	YIL086C	YIL086C	309 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	SYN8	YAL014C	768 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	YAL044W-A	YAL044W-A	333 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	KTR2	YKR061W	1278 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	PRM9	YAR031W	897 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	RPS31	YLR167W	459 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	BUD17	YNR027W	954 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	YOL050C	YOL050C	321 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	CUE5	YOR042W	1236 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	CKS1	YBR135W	453 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	PUT2	YHR037W	1728 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	YLR152C	YLR152C	1731 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	YDL172C	YDL172C	480 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	SEM1	YDR363W-A	270 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	YGR273C	YGR273C	525 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	BGL2	YGR282C	942 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	RPS0B	YLR048W	759 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	SNO1	YMR095C	675 nt		4.57	□□□□□ -1.68

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