Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARFIP1P53367 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARFIP1P53367 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ARFIP1P53367 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP1P53367 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP1P53367 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP1P53367 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP1P53367 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP1P53367 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP1P53367 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP1P53367 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP1P53367 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP1P53367 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP1P53367 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP1P53367 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP1P53367 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP1P53367 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP1P53367 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP1P53367 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP1P53367 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP1P53367 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP1P53367 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP1P53367 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP1P53367 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP1P53367 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP1P53367 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP1P53367 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP1P53367 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP1P53367 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP1P53367 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP1P53367 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP1P53367 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP1P53367 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP1P53367 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP1P53367 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP1P53367 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP1P53367 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP1P53367 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP1P53367 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP1P53367 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP1P53367 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP1P53367 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP1P53367 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP1P53367 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP1P53367 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP1P53367 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP1P53367 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP1P53367 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP1P53367 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP1P53367 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP1P53367 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP1P53367 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP1P53367 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP1P53367 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP1P53367 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFIP1P53367 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms