Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HK3P52790 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HK3P52790 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HK3P52790 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HK3P52790 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HK3P52790 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HK3P52790 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HK3P52790 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HK3P52790 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HK3P52790 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HK3P52790 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HK3P52790 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HK3P52790 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HK3P52790 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HK3P52790 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HK3P52790 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HK3P52790 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HK3P52790 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HK3P52790 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HK3P52790 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HK3P52790 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HK3P52790 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HK3P52790 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HK3P52790 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HK3P52790 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HK3P52790 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HK3P52790 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HK3P52790 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HK3P52790 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HK3P52790 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HK3P52790 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HK3P52790 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HK3P52790 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HK3P52790 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HK3P52790 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HK3P52790 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HK3P52790 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HK3P52790 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HK3P52790 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HK3P52790 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HK3P52790 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HK3P52790 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HK3P52790 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HK3P52790 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HK3P52790 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HK3P52790 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HK3P52790 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HK3P52790 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HK3P52790 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HK3P52790 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HK3P52790 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HK3P52790 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HK3P52790 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HK3P52790 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HK3P52790 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HK3P52790 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HK3P52790 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HK3P52790 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HK3P52790 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HK3P52790 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HK3P52790 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HK3P52790 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HK3P52790 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HK3P52790 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HK3P52790 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HK3P52790 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HK3P52790 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HK3P52790 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HK3P52790 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HK3P52790 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HK3P52790 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HK3P52790 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HK3P52790 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HK3P52790 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HK3P52790 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HK3P52790 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HK3P52790 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HK3P52790 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HK3P52790 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HK3P52790 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HK3P52790 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HK3P52790 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HK3P52790 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HK3P52790 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HK3P52790 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HK3P52790 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HK3P52790 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HK3P52790 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HK3P52790 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HK3P52790 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HK3P52790 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HK3P52790 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HK3P52790 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HK3P52790 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HK3P52790 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HK3P52790 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HK3P52790 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HK3P52790 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HK3P52790 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HK3P52790 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms