Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms