Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC41.02■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
SMARCA4P51532 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
SMARCA4P51532 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC40.92■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms