Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms