Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB27AP51159 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms