Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8P50990 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8P50990 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8P50990 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8P50990 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8P50990 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8P50990 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8P50990 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8P50990 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8P50990 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8P50990 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8P50990 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8P50990 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8P50990 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8P50990 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8P50990 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8P50990 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8P50990 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8P50990 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8P50990 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8P50990 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8P50990 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8P50990 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8P50990 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8P50990 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8P50990 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8P50990 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8P50990 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8P50990 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8P50990 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8P50990 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8P50990 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8P50990 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT8P50990 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT8P50990 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT8P50990 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT8P50990 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT8P50990 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT8P50990 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT8P50990 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT8P50990 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT8P50990 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT8P50990 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT8P50990 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT8P50990 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT8P50990 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT8P50990 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT8P50990 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT8P50990 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT8P50990 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT8P50990 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT8P50990 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT8P50990 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT8P50990 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT8P50990 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT8P50990 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT8P50990 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT8P50990 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT8P50990 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT8P50990 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT8P50990 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT8P50990 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT8P50990 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT8P50990 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT8P50990 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT8P50990 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT8P50990 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT8P50990 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT8P50990 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT8P50990 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT8P50990 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT8P50990 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT8P50990 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT8P50990 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT8P50990 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT8P50990 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT8P50990 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT8P50990 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT8P50990 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT8P50990 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT8P50990 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT8P50990 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT8P50990 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT8P50990 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT8P50990 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCT8P50990 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCT8P50990 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8P50990 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8P50990 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8P50990 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8P50990 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8P50990 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8P50990 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8P50990 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8P50990 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8P50990 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8P50990 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8P50990 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8P50990 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8P50990 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.4 ms