Protein–RNA interactions for Protein: P50875

SPT20, Transcription factor SPT20, yeastyeast

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT20P50875 YCR108CYCR108C 192 nt5.42□□□□□ -1.54
SPT20P50875 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt5.42□□□□□ -1.54
SPT20P50875 TAL1YLR354C 1008 nt5.42□□□□□ -1.54
SPT20P50875 IAH1YOR126C 717 nt5.42□□□□□ -1.54
SPT20P50875 GAL7YBR018C 1101 nt5.42□□□□□ -1.54
SPT20P50875 DIM1YPL266W 957 nt5.42□□□□□ -1.54
SPT20P50875 VMS1YDR049W 1899 nt5.42□□□□□ -1.54
SPT20P50875 SPS2YDR522C 1509 nt5.42□□□□□ -1.54
SPT20P50875 COM2YER130C 1332 nt5.42□□□□□ -1.54
SPT20P50875 RIM101YHL027W 1878 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT20P50875 RVS161YCR009C 798 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT20P50875 DSD1YGL196W 1287 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT20P50875 PHB1YGR132C 864 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT20P50875 YJR157WYJR157W 363 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT20P50875 YJU3YKL094W 942 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT20P50875 GSP1YLR293C 660 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT20P50875 CDC73YLR418C 1182 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT20P50875 AIM36YMR157C 768 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT20P50875 YNL320WYNL320W 855 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT20P50875 MDY2YOL111C 639 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT20P50875 AAD15YOL165C 432 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT20P50875 YOR238WYOR238W 912 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT20P50875 CPA1YOR303W 1236 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT20P50875 UBC11YOR339C 471 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT20P50875 ATG12YBR217W 561 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT20P50875 YIL001WYIL001W 1542 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT20P50875 GCN5YGR252W 1320 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT20P50875 BI3Q0115 1554 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT20P50875 PCS60YBR222C 1632 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT20P50875 STL1YDR536W 1710 nt5.4□□□□□ -1.54
SPT20P50875 HIR1YBL008W 2523 nt5.4□□□□□ -1.54
SPT20P50875 YDL172CYDL172C 480 nt5.4□□□□□ -1.54
SPT20P50875 TIM21YGR033C 720 nt5.4□□□□□ -1.54
SPT20P50875 RPI1YIL119C 1224 nt5.4□□□□□ -1.54
SPT20P50875 IME1YJR094C 1083 nt5.4□□□□□ -1.54
SPT20P50875 SRP21YKL122C 504 nt5.4□□□□□ -1.54
SPT20P50875 GEP5YLR091W 882 nt5.4□□□□□ -1.54
SPT20P50875 YLR296WYLR296W 327 nt5.4□□□□□ -1.54
SPT20P50875 CSI2YOL007C 1026 nt5.4□□□□□ -1.54
SPT20P50875 MPD1YOR288C 957 nt5.4□□□□□ -1.54
SPT20P50875 YPL199CYPL199C 723 nt5.4□□□□□ -1.54
SPT20P50875 YBR287WYBR287W 1284 nt5.4□□□□□ -1.54
SPT20P50875 HSP78YDR258C 2436 nt5.4□□□□□ -1.55
SPT20P50875 MTH1YDR277C 1302 nt5.4□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YPK2YMR104C 2034 nt5.4□□□□□ -1.55
SPT20P50875 CRZ1YNL027W 2037 nt5.4□□□□□ -1.55
SPT20P50875 CIK1YMR198W 1785 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT20P50875 FUM1YPL262W 1467 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT20P50875 MRK1YDL079C 1506 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT20P50875 ROG3YFR022W 2202 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT20P50875 MCM3YEL032W 2916 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT20P50875 EFG1YGR271C-A 702 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT20P50875 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT20P50875 HTD2YHR067W 843 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT20P50875 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT20P50875 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YLR049CYLR049C 1287 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT20P50875 ATG38YLR211C 681 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT20P50875 MUM2YBR057C 1101 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT20P50875 HUT1YPL244C 1020 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YBR071WYBR071W 636 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YBR116CYBR116C 528 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT20P50875 SHM1YBR263W 1473 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT20P50875 PYC1YGL062W 3537 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT20P50875 TLG1YDR468C 675 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT20P50875 LSM4YER112W 564 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT20P50875 COS4YFL062W 1140 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT20P50875 SOH1YGL127C 384 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT20P50875 RME1YGR044C 903 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT20P50875 CAB2YIL083C 1098 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT20P50875 TEF4YKL081W 1239 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YMR085WYMR085W 1299 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YIM1YMR152W 1098 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT20P50875 GPI12YMR281W 915 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YOL131WYOL131W 327 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT20P50875 BNA5YLR231C 1362 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT20P50875 WTM2YOR229W 1404 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT20P50875 PUF3YLL013C 2640 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT20P50875 GIT1YCR098C 1557 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT20P50875 ERT1YBR239C 1590 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YMR155WYMR155W 1644 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT20P50875 CHO1YER026C 831 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT20P50875 RPL24BYGR148C 468 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT20P50875 RSR1YGR152C 819 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT20P50875 MRPL13YKR006C 795 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT20P50875 BOS1YLR078C 735 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT20P50875 POR1YNL055C 852 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT20P50875 SPS19YNL202W 879 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT20P50875 ELA1YNL230C 1140 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT20P50875 SER1YOR184W 1188 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT20P50875 PNG1YPL096W 1092 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT20P50875 GPT2YKR067W 2232 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT20P50875 TRP3YKL211C 1455 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT20P50875 CST6YIL036W 1764 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT20P50875 FRE7YOL152W 1863 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.5 ms