Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBP50607 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBP50607 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBP50607 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBP50607 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBP50607 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBP50607 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBP50607 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBP50607 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBP50607 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBP50607 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBP50607 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBP50607 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBP50607 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBP50607 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBP50607 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBP50607 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBP50607 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBP50607 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBP50607 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBP50607 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBP50607 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBP50607 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBP50607 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBP50607 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBP50607 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBP50607 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBP50607 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBP50607 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBP50607 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBP50607 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBP50607 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBP50607 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBP50607 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBP50607 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBP50607 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBP50607 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBP50607 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBP50607 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBP50607 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBP50607 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBP50607 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBP50607 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBP50607 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBP50607 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBP50607 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBP50607 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBP50607 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBP50607 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBP50607 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBP50607 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBP50607 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBP50607 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBP50607 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBP50607 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBP50607 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBP50607 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBP50607 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBP50607 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBP50607 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBP50607 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBP50607 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBP50607 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBP50607 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBP50607 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBP50607 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBP50607 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBP50607 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBP50607 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBP50607 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBP50607 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBP50607 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBP50607 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBP50607 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBP50607 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBP50607 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBP50607 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBP50607 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBP50607 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBP50607 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBP50607 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBP50607 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBP50607 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBP50607 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBP50607 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBP50607 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBP50607 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBP50607 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBP50607 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBP50607 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBP50607 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBP50607 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBP50607 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBP50607 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBP50607 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBP50607 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBP50607 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBP50607 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBP50607 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBP50607 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms