Protein–RNA interactions for Protein: P50591

TNFSF10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF10P50591 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF10P50591 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF10P50591 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF10P50591 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF10P50591 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF10P50591 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF10P50591 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFSF10P50591 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFSF10P50591 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFSF10P50591 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFSF10P50591 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFSF10P50591 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF10P50591 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms