Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP1P50238 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms