Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms