Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PSMB3P49720 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB3P49720 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms