Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTPAP49638 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTPAP49638 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTPAP49638 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTPAP49638 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTPAP49638 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTPAP49638 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTPAP49638 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TTPAP49638 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTPAP49638 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTPAP49638 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTPAP49638 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTPAP49638 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTPAP49638 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTPAP49638 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTPAP49638 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTPAP49638 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTPAP49638 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTPAP49638 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTPAP49638 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTPAP49638 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTPAP49638 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTPAP49638 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTPAP49638 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTPAP49638 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTPAP49638 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTPAP49638 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTPAP49638 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTPAP49638 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTPAP49638 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTPAP49638 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTPAP49638 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTPAP49638 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTPAP49638 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTPAP49638 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTPAP49638 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTPAP49638 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTPAP49638 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTPAP49638 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTPAP49638 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTPAP49638 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTPAP49638 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTPAP49638 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTPAP49638 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTPAP49638 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTPAP49638 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTPAP49638 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTPAP49638 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTPAP49638 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTPAP49638 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTPAP49638 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTPAP49638 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTPAP49638 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTPAP49638 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTPAP49638 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTPAP49638 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTPAP49638 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTPAP49638 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTPAP49638 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTPAP49638 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTPAP49638 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTPAP49638 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTPAP49638 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTPAP49638 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTPAP49638 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTPAP49638 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTPAP49638 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTPAP49638 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTPAP49638 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTPAP49638 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTPAP49638 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTPAP49638 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTPAP49638 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTPAP49638 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTPAP49638 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTPAP49638 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTPAP49638 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTPAP49638 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTPAP49638 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTPAP49638 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTPAP49638 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTPAP49638 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTPAP49638 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTPAP49638 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTPAP49638 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTPAP49638 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTPAP49638 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTPAP49638 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTPAP49638 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTPAP49638 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTPAP49638 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTPAP49638 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTPAP49638 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTPAP49638 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTPAP49638 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTPAP49638 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTPAP49638 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTPAP49638 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTPAP49638 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTPAP49638 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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