Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT3P49368 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT3P49368 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT3P49368 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT3P49368 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT3P49368 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT3P49368 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT3P49368 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT3P49368 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT3P49368 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT3P49368 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT3P49368 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT3P49368 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT3P49368 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT3P49368 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT3P49368 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT3P49368 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT3P49368 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT3P49368 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT3P49368 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT3P49368 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT3P49368 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT3P49368 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT3P49368 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT3P49368 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCT3P49368 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCT3P49368 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCT3P49368 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CCT3P49368 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCT3P49368 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCT3P49368 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCT3P49368 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCT3P49368 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCT3P49368 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCT3P49368 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT3P49368 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT3P49368 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT3P49368 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT3P49368 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT3P49368 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT3P49368 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT3P49368 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT3P49368 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT3P49368 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCT3P49368 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCT3P49368 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCT3P49368 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCT3P49368 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCT3P49368 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCT3P49368 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCT3P49368 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCT3P49368 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCT3P49368 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCT3P49368 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCT3P49368 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCT3P49368 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCT3P49368 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCT3P49368 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCT3P49368 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCT3P49368 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCT3P49368 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCT3P49368 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCT3P49368 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCT3P49368 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCT3P49368 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCT3P49368 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCT3P49368 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCT3P49368 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCT3P49368 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCT3P49368 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCT3P49368 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCT3P49368 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCT3P49368 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCT3P49368 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCT3P49368 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCT3P49368 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCT3P49368 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCT3P49368 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCT3P49368 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCT3P49368 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCT3P49368 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCT3P49368 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCT3P49368 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCT3P49368 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCT3P49368 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCT3P49368 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCT3P49368 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCT3P49368 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCT3P49368 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCT3P49368 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCT3P49368 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCT3P49368 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCT3P49368 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCT3P49368 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCT3P49368 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCT3P49368 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCT3P49368 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCT3P49368 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCT3P49368 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCT3P49368 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms