Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM4P49221 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM4P49221 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM4P49221 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM4P49221 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM4P49221 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM4P49221 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM4P49221 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM4P49221 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM4P49221 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM4P49221 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM4P49221 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM4P49221 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM4P49221 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM4P49221 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM4P49221 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM4P49221 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM4P49221 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM4P49221 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM4P49221 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGM4P49221 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGM4P49221 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGM4P49221 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TGM4P49221 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGM4P49221 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TGM4P49221 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TGM4P49221 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TGM4P49221 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM4P49221 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM4P49221 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM4P49221 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM4P49221 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM4P49221 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM4P49221 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM4P49221 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM4P49221 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM4P49221 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM4P49221 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM4P49221 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM4P49221 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM4P49221 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM4P49221 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM4P49221 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM4P49221 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM4P49221 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM4P49221 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM4P49221 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM4P49221 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM4P49221 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM4P49221 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM4P49221 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM4P49221 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM4P49221 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM4P49221 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM4P49221 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM4P49221 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM4P49221 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM4P49221 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM4P49221 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM4P49221 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM4P49221 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM4P49221 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM4P49221 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM4P49221 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM4P49221 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM4P49221 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM4P49221 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM4P49221 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM4P49221 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM4P49221 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM4P49221 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM4P49221 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM4P49221 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM4P49221 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM4P49221 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM4P49221 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM4P49221 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM4P49221 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM4P49221 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM4P49221 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM4P49221 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM4P49221 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM4P49221 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM4P49221 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM4P49221 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM4P49221 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM4P49221 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM4P49221 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM4P49221 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM4P49221 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM4P49221 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms