Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RXRGP48443 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RXRGP48443 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RXRGP48443 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RXRGP48443 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RXRGP48443 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RXRGP48443 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RXRGP48443 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RXRGP48443 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RXRGP48443 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RXRGP48443 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RXRGP48443 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RXRGP48443 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RXRGP48443 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RXRGP48443 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RXRGP48443 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RXRGP48443 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RXRGP48443 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RXRGP48443 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RXRGP48443 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RXRGP48443 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RXRGP48443 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RXRGP48443 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RXRGP48443 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RXRGP48443 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RXRGP48443 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RXRGP48443 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RXRGP48443 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RXRGP48443 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RXRGP48443 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RXRGP48443 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RXRGP48443 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RXRGP48443 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RXRGP48443 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RXRGP48443 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RXRGP48443 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RXRGP48443 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RXRGP48443 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RXRGP48443 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RXRGP48443 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RXRGP48443 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RXRGP48443 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RXRGP48443 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RXRGP48443 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RXRGP48443 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RXRGP48443 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RXRGP48443 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RXRGP48443 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RXRGP48443 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RXRGP48443 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RXRGP48443 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RXRGP48443 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RXRGP48443 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RXRGP48443 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RXRGP48443 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RXRGP48443 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RXRGP48443 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RXRGP48443 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RXRGP48443 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RXRGP48443 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RXRGP48443 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RXRGP48443 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RXRGP48443 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RXRGP48443 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RXRGP48443 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RXRGP48443 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RXRGP48443 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RXRGP48443 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RXRGP48443 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RXRGP48443 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RXRGP48443 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RXRGP48443 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RXRGP48443 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RXRGP48443 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RXRGP48443 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RXRGP48443 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RXRGP48443 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RXRGP48443 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RXRGP48443 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RXRGP48443 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RXRGP48443 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RXRGP48443 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RXRGP48443 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RXRGP48443 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RXRGP48443 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RXRGP48443 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RXRGP48443 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RXRGP48443 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RXRGP48443 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RXRGP48443 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RXRGP48443 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RXRGP48443 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RXRGP48443 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RXRGP48443 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RXRGP48443 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RXRGP48443 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RXRGP48443 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RXRGP48443 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RXRGP48443 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RXRGP48443 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms