Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TM4SF4P48230 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF4P48230 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms