Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNJ1P48048 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms