Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 TAF10YDR167W 621 nt4.7□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 YIL028WYIL028W 399 nt4.7□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 ROT1YMR200W 771 nt4.7□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 MED4YOR174W 855 nt4.7□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 FAR10YLR238W 1437 nt4.7□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 PRM7YDL039C 2097 nt4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 YIL001WYIL001W 1542 nt4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 BNA6YFR047C 888 nt4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 FMP33YJL161W 543 nt4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 MAC1YMR021C 1254 nt4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 RRN9YMR270C 1098 nt4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 ELC1YPL046C 300 nt4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 TGS1YPL157W 948 nt4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 MRE11YMR224C 2079 nt4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 YGR266WYGR266W 2106 nt4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 MPH2YDL247W 1830 nt4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 GCV1YDR019C 1203 nt4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 EAF5YEL018W 840 nt4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 YAR023CYAR023C 540 nt4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 TOM40YMR203W 1164 nt4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 YNG1YOR064C 660 nt4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 UPC2YDR213W 2742 nt4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 KIC1YHR102W 3243 nt4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 HRK1YOR267C 2280 nt4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 YHR177WYHR177W 1362 nt4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 IFM1YOL023W 2031 nt4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 RKM2YDR198C 1440 nt4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 TFB3YDR460W 966 nt4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 YKR104WYKR104W 921 nt4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 CDC15YAR019C 2925 nt4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 MNN4YKL201C 3537 nt4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 ESF1YDR365C 1887 nt4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 ACT1YFL039C 1128 nt4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 YJL218WYJL218W 591 nt4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 CDC42YLR229C 576 nt4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 GTR1YML121W 933 nt4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 NAT5YOR253W 531 nt4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 YOR292CYOR292C 930 nt4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 YPL025CYPL025C 558 nt4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 YPL113CYPL113C 1191 nt4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 YPL278CYPL278C 303 nt4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 KCC4YCL024W 3114 nt4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 BSC5YNR069C 1470 nt4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 SAC1YKL212W 1872 nt4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 GSY1YFR015C 2127 nt4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 SLD2YKL108W 1362 nt4.65□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 MET12YPL023C 1974 nt4.65□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 THI13YDL244W 1023 nt4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 ENT5YDR153C 1236 nt4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 NUP42YDR192C 1293 nt4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 THI11YJR156C 1023 nt4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 RAD27YKL113C 1149 nt4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 YBL010CYBL010C 843 nt4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 RFA2YNL312W 822 nt4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 TOG1YER184C 2385 nt4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 HIS4YCL030C 2400 nt4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 snR7-LsnR7-L 214 nt4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 TRM8YDL201W 861 nt4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 RTT103YDR289C 1230 nt4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 RFC2YJR068W 1062 nt4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 YKL169CYKL169C 384 nt4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 NKP2YLR315W 462 nt4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 GPI12YMR281W 915 nt4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 HUL4YJR036C 2679 nt4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 PMC1YGL006W 3522 nt4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 JHD2YJR119C 2187 nt4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 IML2YJL082W 2196 nt4.63□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 YLR407WYLR407W 687 nt4.63□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 OPY2YPR075C 1083 nt4.63□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 PBN1YCL052C 1251 nt4.63□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 PRP31YGR091W 1485 nt4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 KRE28YDR532C 1158 nt4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 PAU17YLL025W 375 nt4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 SVF1YDR346C 1446 nt4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 HOT1YMR172W 2160 nt4.61□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 THI20YOL055C 1656 nt4.61□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 TPO2YGR138C 1845 nt4.61□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 LYP1YNL268W 1836 nt4.61□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 SEC72YLR292C 582 nt4.61□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 YNL181WYNL181W 1224 nt4.61□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 EMP47YFL048C 1338 nt4.61□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 RIA1YNL163C 3333 nt4.61□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 KIN28YDL108W 921 nt4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 snR19snR19 568 nt4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 STB2YMR053C 2553 nt4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 TGL4YKR089C 2733 nt4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 CDS1YBR029C 1374 nt4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 NNK1YKL171W 2787 nt4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 STR2YJR130C 1920 nt4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 TRF5YNL299W 1929 nt4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 COQ4YDR204W 1008 nt4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 YFT2YDR319C 825 nt4.59□□□□□ -1.67
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