Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX1P40424 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX1P40424 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX1P40424 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX1P40424 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX1P40424 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX1P40424 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX1P40424 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX1P40424 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX1P40424 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX1P40424 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX1P40424 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX1P40424 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX1P40424 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX1P40424 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX1P40424 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX1P40424 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX1P40424 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX1P40424 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX1P40424 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX1P40424 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX1P40424 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX1P40424 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX1P40424 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX1P40424 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX1P40424 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX1P40424 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX1P40424 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX1P40424 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX1P40424 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX1P40424 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX1P40424 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX1P40424 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX1P40424 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX1P40424 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX1P40424 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX1P40424 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX1P40424 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX1P40424 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX1P40424 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX1P40424 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX1P40424 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX1P40424 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX1P40424 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX1P40424 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX1P40424 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX1P40424 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX1P40424 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX1P40424 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX1P40424 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX1P40424 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX1P40424 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX1P40424 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX1P40424 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX1P40424 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX1P40424 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX1P40424 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX1P40424 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX1P40424 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX1P40424 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX1P40424 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX1P40424 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX1P40424 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX1P40424 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX1P40424 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX1P40424 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX1P40424 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX1P40424 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX1P40424 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX1P40424 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX1P40424 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX1P40424 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX1P40424 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX1P40424 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX1P40424 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX1P40424 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX1P40424 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX1P40424 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX1P40424 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX1P40424 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX1P40424 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX1P40424 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX1P40424 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX1P40424 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX1P40424 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX1P40424 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX1P40424 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX1P40424 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX1P40424 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX1P40424 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX1P40424 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PBX1P40424 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PBX1P40424 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX1P40424 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX1P40424 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX1P40424 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX1P40424 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX1P40424 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX1P40424 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX1P40424 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms