Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRCA1P38398 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRCA1P38398 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRCA1P38398 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRCA1P38398 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRCA1P38398 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRCA1P38398 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRCA1P38398 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRCA1P38398 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRCA1P38398 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRCA1P38398 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRCA1P38398 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BRCA1P38398 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BRCA1P38398 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRCA1P38398 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRCA1P38398 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRCA1P38398 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRCA1P38398 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BRCA1P38398 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRCA1P38398 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRCA1P38398 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRCA1P38398 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms