Protein–RNA interactions for Protein: P38148

PPS1, Dual specificity protein phosphatase PPS1, yeastyeast

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PPS1P38148 YGL177WYGL177W 348 nt5.34□□□□□ -1.55
PPS1P38148 DID4YKL002W 699 nt5.34□□□□□ -1.55
PPS1P38148 MRT4YKL009W 711 nt5.34□□□□□ -1.55
PPS1P38148 VPS1YKR001C 2115 nt5.34□□□□□ -1.55
PPS1P38148 YNL143CYNL143C 393 nt5.34□□□□□ -1.55
PPS1P38148 LTO1YNL260C 597 nt5.34□□□□□ -1.55
PPS1P38148 MCH4YOL119C 1506 nt5.33□□□□□ -1.56
PPS1P38148 ECM7YLR443W 1347 nt5.33□□□□□ -1.56
PPS1P38148 ROT2YBR229C 2865 nt5.33□□□□□ -1.56
PPS1P38148 PTC1YDL006W 846 nt5.33□□□□□ -1.56
PPS1P38148 RPL28YGL103W 450 nt5.33□□□□□ -1.56
PPS1P38148 VAM7YGL212W 951 nt5.33□□□□□ -1.56
PPS1P38148 SPO11YHL022C 1197 nt5.33□□□□□ -1.56
PPS1P38148 YMR181CYMR181C 465 nt5.33□□□□□ -1.56
PPS1P38148 DOM34YNL001W 1161 nt5.33□□□□□ -1.56
PPS1P38148 TRM10YOL093W 882 nt5.33□□□□□ -1.56
PPS1P38148 YOR342CYOR342C 960 nt5.33□□□□□ -1.56
PPS1P38148 APA1YCL050C 966 nt5.33□□□□□ -1.56
PPS1P38148 YAP1802YGR241C 1707 nt5.33□□□□□ -1.56
PPS1P38148 SSU1YPL092W 1377 nt5.32□□□□□ -1.56
PPS1P38148 ALB1YJL122W 528 nt5.32□□□□□ -1.56
PPS1P38148 YPR027CYPR027C 834 nt5.32□□□□□ -1.56
PPS1P38148 snR19snR19 568 nt5.32□□□□□ -1.56
PPS1P38148 SRV2YNL138W 1581 nt5.32□□□□□ -1.56
PPS1P38148 TFG1YGR186W 2208 nt5.32□□□□□ -1.56
PPS1P38148 MGS1YNL218W 1764 nt5.32□□□□□ -1.56
PPS1P38148 RAD7YJR052W 1698 nt5.31□□□□□ -1.56
PPS1P38148 MUP3YHL036W 1641 nt5.31□□□□□ -1.56
PPS1P38148 CBS2YDR197W 1170 nt5.31□□□□□ -1.56
PPS1P38148 RRP45YDR280W 918 nt5.31□□□□□ -1.56
PPS1P38148 YDR417CYDR417C 372 nt5.31□□□□□ -1.56
PPS1P38148 SNM1YDR478W 597 nt5.31□□□□□ -1.56
PPS1P38148 MRF1YGL143C 1242 nt5.31□□□□□ -1.56
PPS1P38148 PEF1YGR058W 1008 nt5.31□□□□□ -1.56
PPS1P38148 RPS31YLR167W 459 nt5.31□□□□□ -1.56
PPS1P38148 YIM2YMR151W 438 nt5.31□□□□□ -1.56
PPS1P38148 IZH4YOL101C 939 nt5.31□□□□□ -1.56
PPS1P38148 FEX1YOR390W 1128 nt5.31□□□□□ -1.56
PPS1P38148 TAF3YPL011C 1062 nt5.31□□□□□ -1.56
PPS1P38148 SET6YPL165C 1122 nt5.31□□□□□ -1.56
PPS1P38148 FEX2YPL279C 1128 nt5.31□□□□□ -1.56
PPS1P38148 YPR153WYPR153W 423 nt5.31□□□□□ -1.56
PPS1P38148 MAD3YJL013C 1548 nt5.31□□□□□ -1.56
PPS1P38148 SIP5YMR140W 1470 nt5.31□□□□□ -1.56
PPS1P38148 YMR102CYMR102C 2505 nt5.31□□□□□ -1.56
PPS1P38148 ECM18YDR125C 1362 nt5.3□□□□□ -1.56
PPS1P38148 CUS1YMR240C 1311 nt5.3□□□□□ -1.56
PPS1P38148 COT1YOR316C 1320 nt5.3□□□□□ -1.56
PPS1P38148 SED4YCR067C 3198 nt5.3□□□□□ -1.56
PPS1P38148 NOP16YER002W 696 nt5.3□□□□□ -1.56
PPS1P38148 JAC1YGL018C 555 nt5.3□□□□□ -1.56
PPS1P38148 TRX2YGR209C 315 nt5.3□□□□□ -1.56
PPS1P38148 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt5.3□□□□□ -1.56
PPS1P38148 DBP8YHR169W 1296 nt5.3□□□□□ -1.56
PPS1P38148 YJL032WYJL032W 315 nt5.3□□□□□ -1.56
PPS1P38148 YLR326WYLR326W 723 nt5.3□□□□□ -1.56
PPS1P38148 TAP42YMR028W 1101 nt5.3□□□□□ -1.56
PPS1P38148 YBL062WYBL062W 381 nt5.3□□□□□ -1.56
PPS1P38148 YNR025CYNR025C 360 nt5.3□□□□□ -1.56
PPS1P38148 TRS33YOR115C 807 nt5.3□□□□□ -1.56
PPS1P38148 YOR289WYOR289W 756 nt5.3□□□□□ -1.56
PPS1P38148 SFG1YOR315W 1041 nt5.3□□□□□ -1.56
PPS1P38148 QCR2YPR191W 1107 nt5.3□□□□□ -1.56
PPS1P38148 NSI1YDR026C 1713 nt5.3□□□□□ -1.56
PPS1P38148 SLS1YLR139C 1932 nt5.29□□□□□ -1.56
PPS1P38148 DOA1YKL213C 2148 nt5.29□□□□□ -1.56
PPS1P38148 YLR108CYLR108C 1458 nt5.29□□□□□ -1.56
PPS1P38148 MHF2YDL160C-A 243 nt5.29□□□□□ -1.56
PPS1P38148 YIL089WYIL089W 618 nt5.29□□□□□ -1.56
PPS1P38148 YLR407WYLR407W 687 nt5.29□□□□□ -1.56
PPS1P38148 DCI1YOR180C 816 nt5.29□□□□□ -1.56
PPS1P38148 POC4YPL144W 447 nt5.29□□□□□ -1.56
PPS1P38148 NHP6AYPR052C 282 nt5.29□□□□□ -1.56
PPS1P38148 GRS1YBR121C 2004 nt5.29□□□□□ -1.56
PPS1P38148 ELP2YGR200C 2367 nt5.29□□□□□ -1.56
PPS1P38148 MAL13YGR288W 1422 nt5.29□□□□□ -1.56
PPS1P38148 SLD2YKL108W 1362 nt5.29□□□□□ -1.56
PPS1P38148 HRR25YPL204W 1485 nt5.28□□□□□ -1.56
PPS1P38148 PAD1YDR538W 729 nt5.28□□□□□ -1.56
PPS1P38148 CAF16YFL028C 870 nt5.28□□□□□ -1.56
PPS1P38148 ACT1YFL039C 1128 nt5.28□□□□□ -1.56
PPS1P38148 CAB4YGR277C 918 nt5.28□□□□□ -1.56
PPS1P38148 VPS29YHR012W 849 nt5.28□□□□□ -1.56
PPS1P38148 DAN1YJR150C 897 nt5.28□□□□□ -1.56
PPS1P38148 TEX1YNL253W 1269 nt5.28□□□□□ -1.56
PPS1P38148 YPL199CYPL199C 723 nt5.28□□□□□ -1.56
PPS1P38148 MAK11YKL021C 1407 nt5.28□□□□□ -1.56
PPS1P38148 CTS2YDR371W 1536 nt5.28□□□□□ -1.56
PPS1P38148 PRD1YCL057W 2139 nt5.27□□□□□ -1.57
PPS1P38148 SAD1YFR005C 1347 nt5.27□□□□□ -1.57
PPS1P38148 ASA1YPR085C 1332 nt5.27□□□□□ -1.57
PPS1P38148 BTT1YDR252W 450 nt5.27□□□□□ -1.57
PPS1P38148 VMA6YLR447C 1038 nt5.27□□□□□ -1.57
PPS1P38148 YML131WYML131W 1098 nt5.27□□□□□ -1.57
PPS1P38148 ANT1YPR128C 987 nt5.27□□□□□ -1.57
PPS1P38148 OCA5YHL029C 2040 nt5.26□□□□□ -1.57
PPS1P38148 HST4YDR191W 1113 nt5.26□□□□□ -1.57
PPS1P38148 RNH202YDR279W 1053 nt5.26□□□□□ -1.57
PPS1P38148 DCV1YFR012W 609 nt5.26□□□□□ -1.57
PPS1P38148 KEG1YFR042W 603 nt5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.7 ms