Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms