Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNB1P35222 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms