Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
L1CAMP32004 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms