Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHS1P30084 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms