Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGA1P29973 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms