Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCKSP29966 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms