Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM5AP29375 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
KDM5AP29375 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5AP29375 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms