Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FGFR3P22607 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms