Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BPBP20851 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms