Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CASTP20810 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CASTP20810 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASTP20810 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASTP20810 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASTP20810 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASTP20810 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASTP20810 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASTP20810 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASTP20810 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASTP20810 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASTP20810 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASTP20810 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASTP20810 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASTP20810 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASTP20810 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASTP20810 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASTP20810 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASTP20810 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASTP20810 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASTP20810 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASTP20810 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASTP20810 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CASTP20810 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASTP20810 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASTP20810 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASTP20810 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASTP20810 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASTP20810 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASTP20810 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASTP20810 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASTP20810 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASTP20810 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CASTP20810 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASTP20810 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASTP20810 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASTP20810 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASTP20810 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASTP20810 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASTP20810 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASTP20810 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASTP20810 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASTP20810 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASTP20810 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASTP20810 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASTP20810 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASTP20810 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASTP20810 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASTP20810 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASTP20810 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASTP20810 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASTP20810 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASTP20810 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASTP20810 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASTP20810 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASTP20810 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASTP20810 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASTP20810 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASTP20810 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASTP20810 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASTP20810 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASTP20810 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASTP20810 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASTP20810 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASTP20810 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CASTP20810 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASTP20810 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASTP20810 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASTP20810 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASTP20810 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASTP20810 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASTP20810 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASTP20810 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CASTP20810 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASTP20810 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASTP20810 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASTP20810 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASTP20810 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASTP20810 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASTP20810 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASTP20810 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASTP20810 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASTP20810 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASTP20810 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASTP20810 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASTP20810 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASTP20810 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASTP20810 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASTP20810 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASTP20810 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASTP20810 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASTP20810 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASTP20810 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASTP20810 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASTP20810 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASTP20810 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASTP20810 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASTP20810 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASTP20810 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASTP20810 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms