Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDCP19113 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDCP19113 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDCP19113 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDCP19113 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDCP19113 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDCP19113 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HDCP19113 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HDCP19113 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDCP19113 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDCP19113 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDCP19113 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDCP19113 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDCP19113 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDCP19113 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HDCP19113 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDCP19113 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDCP19113 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDCP19113 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDCP19113 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDCP19113 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDCP19113 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDCP19113 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDCP19113 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDCP19113 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDCP19113 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDCP19113 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDCP19113 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDCP19113 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDCP19113 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDCP19113 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDCP19113 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDCP19113 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDCP19113 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDCP19113 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDCP19113 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDCP19113 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDCP19113 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HDCP19113 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDCP19113 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDCP19113 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDCP19113 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDCP19113 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDCP19113 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDCP19113 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDCP19113 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDCP19113 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDCP19113 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDCP19113 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDCP19113 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDCP19113 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDCP19113 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDCP19113 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDCP19113 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDCP19113 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDCP19113 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDCP19113 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDCP19113 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDCP19113 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDCP19113 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDCP19113 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDCP19113 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDCP19113 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDCP19113 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDCP19113 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDCP19113 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDCP19113 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDCP19113 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDCP19113 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDCP19113 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDCP19113 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDCP19113 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDCP19113 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDCP19113 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDCP19113 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDCP19113 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDCP19113 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDCP19113 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms