Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARF4P18085 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARF4P18085 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARF4P18085 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARF4P18085 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARF4P18085 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARF4P18085 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARF4P18085 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARF4P18085 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARF4P18085 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARF4P18085 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARF4P18085 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARF4P18085 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARF4P18085 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARF4P18085 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARF4P18085 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARF4P18085 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARF4P18085 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARF4P18085 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARF4P18085 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARF4P18085 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARF4P18085 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARF4P18085 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARF4P18085 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARF4P18085 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARF4P18085 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARF4P18085 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARF4P18085 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARF4P18085 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARF4P18085 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARF4P18085 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARF4P18085 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARF4P18085 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARF4P18085 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARF4P18085 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARF4P18085 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARF4P18085 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARF4P18085 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARF4P18085 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARF4P18085 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARF4P18085 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARF4P18085 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARF4P18085 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARF4P18085 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARF4P18085 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARF4P18085 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARF4P18085 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARF4P18085 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARF4P18085 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARF4P18085 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ARF4P18085 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARF4P18085 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARF4P18085 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARF4P18085 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARF4P18085 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARF4P18085 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARF4P18085 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARF4P18085 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARF4P18085 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARF4P18085 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARF4P18085 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARF4P18085 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARF4P18085 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARF4P18085 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARF4P18085 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARF4P18085 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ARF4P18085 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARF4P18085 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARF4P18085 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARF4P18085 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARF4P18085 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARF4P18085 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARF4P18085 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARF4P18085 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARF4P18085 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARF4P18085 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARF4P18085 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARF4P18085 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARF4P18085 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARF4P18085 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARF4P18085 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARF4P18085 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARF4P18085 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARF4P18085 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARF4P18085 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARF4P18085 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARF4P18085 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARF4P18085 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARF4P18085 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARF4P18085 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARF4P18085 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ARF4P18085 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARF4P18085 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARF4P18085 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARF4P18085 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARF4P18085 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARF4P18085 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARF4P18085 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARF4P18085 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARF4P18085 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms