Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB5P18084 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms