Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMD1P17707 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMD1P17707 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMD1P17707 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AMD1P17707 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMD1P17707 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMD1P17707 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMD1P17707 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMD1P17707 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMD1P17707 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMD1P17707 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMD1P17707 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMD1P17707 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMD1P17707 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMD1P17707 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMD1P17707 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMD1P17707 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMD1P17707 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMD1P17707 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMD1P17707 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMD1P17707 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMD1P17707 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMD1P17707 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMD1P17707 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMD1P17707 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMD1P17707 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMD1P17707 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMD1P17707 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMD1P17707 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMD1P17707 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMD1P17707 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMD1P17707 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMD1P17707 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMD1P17707 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMD1P17707 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMD1P17707 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMD1P17707 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMD1P17707 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMD1P17707 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMD1P17707 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMD1P17707 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMD1P17707 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMD1P17707 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMD1P17707 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMD1P17707 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMD1P17707 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMD1P17707 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMD1P17707 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMD1P17707 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMD1P17707 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMD1P17707 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMD1P17707 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMD1P17707 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMD1P17707 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMD1P17707 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMD1P17707 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMD1P17707 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMD1P17707 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AMD1P17707 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMD1P17707 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMD1P17707 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMD1P17707 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMD1P17707 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMD1P17707 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AMD1P17707 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMD1P17707 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMD1P17707 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AMD1P17707 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMD1P17707 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMD1P17707 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMD1P17707 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMD1P17707 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMD1P17707 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMD1P17707 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMD1P17707 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AMD1P17707 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMD1P17707 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AMD1P17707 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMD1P17707 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMD1P17707 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AMD1P17707 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AMD1P17707 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMD1P17707 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMD1P17707 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMD1P17707 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMD1P17707 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AMD1P17707 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMD1P17707 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMD1P17707 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMD1P17707 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMD1P17707 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMD1P17707 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMD1P17707 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMD1P17707 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMD1P17707 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMD1P17707 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMD1P17707 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMD1P17707 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AMD1P17707 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMD1P17707 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms