Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB1P16220 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB1P16220 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB1P16220 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB1P16220 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB1P16220 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB1P16220 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB1P16220 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB1P16220 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB1P16220 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB1P16220 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB1P16220 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB1P16220 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB1P16220 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB1P16220 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CREB1P16220 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CREB1P16220 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CREB1P16220 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CREB1P16220 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB1P16220 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB1P16220 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB1P16220 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB1P16220 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB1P16220 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB1P16220 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB1P16220 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB1P16220 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB1P16220 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB1P16220 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB1P16220 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB1P16220 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB1P16220 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB1P16220 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB1P16220 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB1P16220 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB1P16220 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB1P16220 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB1P16220 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB1P16220 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB1P16220 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB1P16220 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB1P16220 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB1P16220 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB1P16220 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB1P16220 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB1P16220 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB1P16220 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB1P16220 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB1P16220 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB1P16220 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB1P16220 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB1P16220 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB1P16220 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB1P16220 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB1P16220 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB1P16220 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB1P16220 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB1P16220 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB1P16220 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB1P16220 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB1P16220 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB1P16220 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB1P16220 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB1P16220 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB1P16220 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB1P16220 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB1P16220 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB1P16220 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB1P16220 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB1P16220 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB1P16220 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB1P16220 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB1P16220 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB1P16220 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB1P16220 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB1P16220 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB1P16220 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB1P16220 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB1P16220 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB1P16220 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB1P16220 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB1P16220 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB1P16220 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB1P16220 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB1P16220 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB1P16220 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB1P16220 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB1P16220 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB1P16220 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB1P16220 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB1P16220 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB1P16220 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB1P16220 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB1P16220 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB1P16220 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB1P16220 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB1P16220 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB1P16220 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB1P16220 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB1P16220 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms