Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms