Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNRPBP14678 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPBP14678 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms