Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNT1P13805 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms