Protein–RNA interactions for Protein: P12931

SRC, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCP12931 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRCP12931 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRCP12931 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRCP12931 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRCP12931 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRCP12931 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRCP12931 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRCP12931 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRCP12931 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRCP12931 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRCP12931 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRCP12931 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRCP12931 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRCP12931 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRCP12931 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRCP12931 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRCP12931 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRCP12931 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRCP12931 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRCP12931 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRCP12931 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRCP12931 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRCP12931 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRCP12931 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRCP12931 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRCP12931 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCP12931 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCP12931 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCP12931 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCP12931 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCP12931 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCP12931 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCP12931 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCP12931 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCP12931 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCP12931 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCP12931 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCP12931 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCP12931 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCP12931 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCP12931 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCP12931 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCP12931 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCP12931 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCP12931 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCP12931 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCP12931 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCP12931 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCP12931 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCP12931 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCP12931 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCP12931 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCP12931 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCP12931 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCP12931 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCP12931 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCP12931 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCP12931 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCP12931 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCP12931 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCP12931 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCP12931 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCP12931 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCP12931 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCP12931 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCP12931 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCP12931 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCP12931 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCP12931 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCP12931 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCP12931 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCP12931 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRCP12931 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCP12931 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCP12931 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCP12931 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCP12931 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCP12931 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCP12931 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCP12931 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCP12931 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCP12931 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCP12931 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCP12931 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCP12931 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCP12931 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCP12931 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCP12931 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCP12931 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRCP12931 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRCP12931 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRCP12931 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRCP12931 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRCP12931 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRCP12931 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRCP12931 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRCP12931 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRCP12931 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRCP12931 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRCP12931 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms