Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIP12755 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIP12755 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIP12755 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIP12755 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIP12755 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIP12755 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIP12755 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIP12755 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIP12755 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIP12755 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIP12755 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIP12755 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIP12755 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIP12755 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIP12755 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIP12755 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIP12755 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIP12755 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIP12755 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIP12755 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIP12755 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIP12755 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIP12755 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIP12755 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIP12755 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIP12755 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIP12755 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIP12755 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIP12755 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIP12755 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIP12755 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIP12755 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIP12755 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIP12755 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIP12755 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIP12755 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIP12755 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIP12755 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIP12755 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIP12755 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIP12755 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIP12755 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIP12755 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIP12755 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIP12755 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIP12755 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIP12755 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIP12755 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIP12755 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIP12755 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIP12755 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIP12755 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIP12755 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIP12755 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SKIP12755 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SKIP12755 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKIP12755 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SKIP12755 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKIP12755 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SKIP12755 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKIP12755 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SKIP12755 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKIP12755 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKIP12755 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIP12755 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIP12755 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIP12755 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIP12755 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIP12755 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIP12755 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIP12755 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIP12755 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIP12755 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIP12755 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIP12755 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIP12755 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIP12755 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIP12755 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIP12755 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIP12755 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIP12755 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIP12755 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIP12755 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIP12755 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIP12755 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIP12755 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIP12755 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIP12755 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIP12755 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIP12755 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIP12755 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIP12755 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIP12755 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIP12755 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIP12755 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIP12755 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIP12755 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIP12755 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIP12755 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms