Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNAP12004 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNAP12004 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNAP12004 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNAP12004 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNAP12004 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNAP12004 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNAP12004 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNAP12004 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNAP12004 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNAP12004 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNAP12004 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNAP12004 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNAP12004 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNAP12004 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNAP12004 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNAP12004 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNAP12004 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNAP12004 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNAP12004 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNAP12004 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNAP12004 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNAP12004 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNAP12004 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNAP12004 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNAP12004 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNAP12004 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNAP12004 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNAP12004 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNAP12004 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNAP12004 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNAP12004 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNAP12004 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNAP12004 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNAP12004 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNAP12004 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNAP12004 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNAP12004 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNAP12004 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNAP12004 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNAP12004 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNAP12004 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNAP12004 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNAP12004 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNAP12004 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNAP12004 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNAP12004 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNAP12004 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNAP12004 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNAP12004 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCNAP12004 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCNAP12004 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNAP12004 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNAP12004 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNAP12004 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNAP12004 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNAP12004 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNAP12004 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNAP12004 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNAP12004 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNAP12004 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNAP12004 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNAP12004 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNAP12004 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNAP12004 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNAP12004 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNAP12004 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNAP12004 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNAP12004 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNAP12004 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNAP12004 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNAP12004 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNAP12004 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNAP12004 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNAP12004 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNAP12004 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNAP12004 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNAP12004 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNAP12004 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNAP12004 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNAP12004 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNAP12004 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNAP12004 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNAP12004 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNAP12004 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNAP12004 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNAP12004 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNAP12004 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNAP12004 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNAP12004 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNAP12004 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNAP12004 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNAP12004 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNAP12004 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNAP12004 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNAP12004 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNAP12004 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNAP12004 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNAP12004 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNAP12004 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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