Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPB41P11171 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPB41P11171 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPB41P11171 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPB41P11171 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPB41P11171 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPB41P11171 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPB41P11171 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPB41P11171 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPB41P11171 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPB41P11171 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPB41P11171 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPB41P11171 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPB41P11171 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPB41P11171 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EPB41P11171 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EPB41P11171 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPB41P11171 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPB41P11171 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPB41P11171 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPB41P11171 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPB41P11171 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPB41P11171 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPB41P11171 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPB41P11171 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPB41P11171 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPB41P11171 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPB41P11171 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPB41P11171 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPB41P11171 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPB41P11171 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPB41P11171 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPB41P11171 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPB41P11171 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPB41P11171 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPB41P11171 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPB41P11171 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EPB41P11171 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPB41P11171 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EPB41P11171 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPB41P11171 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPB41P11171 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPB41P11171 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPB41P11171 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPB41P11171 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPB41P11171 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPB41P11171 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPB41P11171 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPB41P11171 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPB41P11171 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPB41P11171 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPB41P11171 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPB41P11171 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPB41P11171 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPB41P11171 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPB41P11171 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPB41P11171 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPB41P11171 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPB41P11171 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPB41P11171 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPB41P11171 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EPB41P11171 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPB41P11171 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPB41P11171 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPB41P11171 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPB41P11171 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPB41P11171 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41P11171 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41P11171 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41P11171 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41P11171 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41P11171 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41P11171 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41P11171 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41P11171 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41P11171 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41P11171 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41P11171 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41P11171 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41P11171 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPB41P11171 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EPB41P11171 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPB41P11171 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPB41P11171 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPB41P11171 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPB41P11171 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPB41P11171 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPB41P11171 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPB41P11171 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPB41P11171 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPB41P11171 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPB41P11171 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EPB41P11171 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPB41P11171 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPB41P11171 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPB41P11171 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EPB41P11171 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EPB41P11171 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPB41P11171 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPB41P11171 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms