Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2P10911 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCF2P10911 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MCF2P10911 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCF2P10911 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCF2P10911 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MCF2P10911 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCF2P10911 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCF2P10911 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCF2P10911 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCF2P10911 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCF2P10911 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MCF2P10911 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MCF2P10911 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCF2P10911 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MCF2P10911 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCF2P10911 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCF2P10911 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCF2P10911 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MCF2P10911 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCF2P10911 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCF2P10911 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCF2P10911 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCF2P10911 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCF2P10911 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCF2P10911 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCF2P10911 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCF2P10911 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCF2P10911 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCF2P10911 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCF2P10911 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCF2P10911 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCF2P10911 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCF2P10911 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCF2P10911 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCF2P10911 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCF2P10911 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCF2P10911 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCF2P10911 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCF2P10911 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCF2P10911 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCF2P10911 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCF2P10911 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCF2P10911 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCF2P10911 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCF2P10911 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCF2P10911 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCF2P10911 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCF2P10911 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCF2P10911 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MCF2P10911 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCF2P10911 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCF2P10911 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCF2P10911 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCF2P10911 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MCF2P10911 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MCF2P10911 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCF2P10911 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2P10911 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2P10911 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2P10911 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2P10911 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2P10911 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2P10911 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2P10911 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2P10911 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2P10911 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2P10911 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCF2P10911 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCF2P10911 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCF2P10911 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCF2P10911 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCF2P10911 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCF2P10911 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCF2P10911 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCF2P10911 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCF2P10911 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCF2P10911 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCF2P10911 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCF2P10911 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCF2P10911 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCF2P10911 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCF2P10911 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MCF2P10911 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCF2P10911 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MCF2P10911 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCF2P10911 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCF2P10911 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCF2P10911 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MCF2P10911 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MCF2P10911 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MCF2P10911 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MCF2P10911 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCF2P10911 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCF2P10911 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCF2P10911 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2P10911 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2P10911 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2P10911 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2P10911 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms