Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLUP10909 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLUP10909 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLUP10909 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLUP10909 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLUP10909 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLUP10909 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLUP10909 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLUP10909 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLUP10909 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLUP10909 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLUP10909 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLUP10909 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLUP10909 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLUP10909 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLUP10909 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLUP10909 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLUP10909 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLUP10909 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLUP10909 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLUP10909 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLUP10909 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLUP10909 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLUP10909 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLUP10909 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLUP10909 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLUP10909 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLUP10909 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLUP10909 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLUP10909 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLUP10909 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLUP10909 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLUP10909 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLUP10909 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLUP10909 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLUP10909 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLUP10909 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLUP10909 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLUP10909 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLUP10909 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLUP10909 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLUP10909 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CLUP10909 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLUP10909 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLUP10909 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLUP10909 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLUP10909 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLUP10909 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLUP10909 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLUP10909 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLUP10909 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLUP10909 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLUP10909 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLUP10909 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLUP10909 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLUP10909 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLUP10909 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLUP10909 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLUP10909 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLUP10909 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLUP10909 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLUP10909 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLUP10909 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLUP10909 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLUP10909 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLUP10909 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLUP10909 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLUP10909 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLUP10909 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLUP10909 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLUP10909 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLUP10909 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLUP10909 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLUP10909 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLUP10909 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLUP10909 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLUP10909 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLUP10909 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLUP10909 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLUP10909 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLUP10909 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLUP10909 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLUP10909 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLUP10909 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLUP10909 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLUP10909 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLUP10909 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLUP10909 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLUP10909 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLUP10909 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLUP10909 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLUP10909 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLUP10909 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLUP10909 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLUP10909 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLUP10909 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLUP10909 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLUP10909 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLUP10909 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLUP10909 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms